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MCC2026决赛题:南海物理—生态耦合模式

MCC 海洋计算挑战赛(Marine Computing Challenge)创办于 2024 年,本届大赛由中国太平洋学会主办、海光信息技术股份有限公司联合并行科技股份有限公司共同承办,是国内海洋智能计算领域标杆赛事。赛事面向大陆及港澳台高校、科研院所师生,聚焦海洋大数据、环境模拟等前沿方向,分初赛、决赛两大环节。

一、模式简介

ROMS-CoSiNE 是由区域海洋模式 ROMS 与生态模式 CoSiNE 耦合形成的物理—生态耦合数值模式,可同时模拟海洋水动力过程和营养盐、浮游植物、浮游动物、碎屑、溶解氧等生态环境要素变化,广泛应用于近海生态环境模拟、生态灾害研究和生态环境预报。

 

二、模式编译

解压赛题文件:

tar -xvf ROMS_CoSiNE.gz

进入代码目录:

cd ROMS_CoSiNE

vim Compilers/Linux-ifort.mk

根据平台环境调整Linux-ifort.mk中的编译选项、MPI配置 和 NetCDF 路径make clean

make

完成编译后生成模式可执行文件oceanM

注:模型代码存放路径/public/home/mcc2026_final/mcc2026_source/ROMS_CoSiNE.gz

 

三、模式运行

撰写测试脚本sub.sh:

#!/bin/bash

#SBATCH -p hx1hdexclu12

#SBATCH -N 1

#SBATCH -n 64

#SBATCH --exclusive

#SBATCH --time=02:00:00

ulimit -s unlimited

ulimit -l unlimited

module purge

source /public/home/mcc2026_final/mcc2026_final/soft/env.sh

rm log_SCS_Dongsha60_2021_daily.txt  

cp ./Inputfiles/SCS/roms_frc_tide_SCS_org.nc ./Inputfiles/SCS/roms_frc_tide_SCS_org.nc

time mpirun  -np 64 ./oceanM ROMS/External/ocean_SCS_Dongsha60_bio15.in > log_SCS_Dongsha60_2021_daily.txt

注:脚本需要用time启动运行计时,可直接在公共目录下复制sub.sh到自己的目录下运行

提交后可通过squeue命令查看运行状态

模式运行完成后,以 time 命令输出的 real 耗时作为最终运行时间

 

四、结果验证

通过脚本提交后确认结果准确性,验证方法如下:

module load anaconda3/2023.09

source activate /public/home/mcc2026_final/.conda/envs/vali_py3.9

python vali.py

注:验证脚本存放路径/public/home/mcc2026_final/mcc2026_source/vali.py,所有的参数验证均需正常通过

 

五、赛题要求

1、参数配置文件ocean_SCS_Dongsha60_bio15.in除核数配置NtileI*NtileJ外,不可修改

2、限制使用单机运行(最大使用128核),运行时间限制在2小时内

3、可以调整编译环境测试

4、不可修改代码模式计算方案、网格设置、积分时间、时间步长、输出设置

5、不可修改初始场、边界场、强迫场和生态参数文件

6、不可关闭生态模块,不可减少生态变量,不可将双向嵌套改为单向嵌套

7、比赛成绩均需在指定平台上统一验证后作为最终统计结果

8、不支持热启动

9、支持dcu卡加速,单机最多8卡可用

 

六、评分规则

1、比赛结果分为上机成绩、专家评审两个环节

2、上机成绩将在满足题目要求、确保结果精度的前提下,依据优化后的程序运行时间进行排名

3、结果验证精度不作为上机成绩,但会作为最终专家评审的参考标准,误差越小说明效果越好

4、结果验证不通过,取消本题上机成绩

5、不可针对某类算例进行针对性、无普适性、非通用优化,否则该部分成绩专家评审阶段酌情扣除

6、如出现作品源代码高度相似情况,则视为同一作品,取消参赛成绩。

 

 

七、作品提交规则和方法

提交内容包括:

1、优化版源代码

2、编译配置及说明文件

3、运行说明文件

4、性能优化过程记录表

5、技术报告PPT(含精度结果验证及最终上机时间截图,ppt自动播放/录屏)


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